Στο γαστρεντερικό σύστημα αναπτύσσεται και διαβιεί ένας μεγάλος αριθμός μικροοργανισμών. Έως και 100 τρισεκατομμύρια συμβιωτικά
Τις τελευταίες δεκαετίες, έχει αυξηθεί δραματικά το ενδιαφέρον για το ανθρώπινο μικροβίωμα και πιο συγκεκριμένα